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轉基因魚是生物體從分類學分支，它包括的類無頜總綱（無頜魚），軟骨（軟骨魚類）和硬骨魚綱（硬骨魚），其遺傳物質（DNA），使用已被改變的基因工程技術。在大多數情況下，目的是為魚類引入一種新特性，這種特性在物種中不是天然存在的，即轉基因。
轉基因魚用于科學研究并作為寵物飼養。并用于水產養殖食品生產。2015年，三文魚被美國食品和藥物管理局（FDA）批準用于商業生產，銷售和消費，使其成為第一個被批準用于人類消費的轉基因動物。已經創造的一些轉基因魚由于有生長激素。這導致幾種物種的生長顯著增加，包括三文魚， 鯉魚和羅非魚。
批評者在幾個方面反對轉基因魚，包括生態問題，動物福利問題以及是否使用它們作為食物是安全的以及是否需要轉基因魚來幫助滿足世界的食物需求。
第一批轉基因魚于1985年在中國生產。截至2013年，約有50種魚類已進行基因改造。這導致了超過400種魚/特性組合。大多數修改都是針對食物種類進行的，例如大西洋三文魚，羅非魚（屬）和鯉魚。
通常，遺傳修飾需要操縱DNA。當基因在常規繁殖的生物體之間轉移時，該過程被稱為順式生成，或當將來自一個物種的基因添加到不同物種時，該過程被稱為轉基因。在這種情況下，基因轉移到所需生物的基因組中，就像魚一樣，需要通過微注射器或基因槍將載體如慢病毒或機械/物理插入到宿主的細胞核中。
轉基因魚用于涵蓋五大領域的研究
增強商業魚類的特性
它們用作生物反應器，用于開發生物醫學重要蛋白質
它們被用作水生污染物的指標
開發新的非哺乳動物動物模型
功能基因組學研究
大多數轉基因魚用于遺傳學和發育的基礎研究。兩種魚類，斑馬魚和三文魚最常被使用，因為它們具有光學透明的絨毛（殼），發育迅速，細胞胚胎易于觀察并且用轉基因DNA微注射，斑馬魚具有再生能力。他們的器官組織。它們也用于藥物發現。轉基因斑馬魚正在探索解除人體器官組織疾病和醫學失敗之謎。例如，斑馬魚用于了解心臟組織修復和再生，以努力研究和發現心血管疾病的治療方法。
已經開發了轉基因虹鱒來研究肌肉發育。引入的轉基因導致綠色熒光出現在發育早期的快肌纖維中，并持續一生。有人建議將魚用作水生污染物的指標或影響發展的其他因素。
在集約化養魚中，魚類保持高放養密度。這意味著他們經常遭受傳染病的傳播，這是轉基因研究正在解決的問題。 已經用編碼人乳鐵蛋白的轉基因修飾了草魚，其在暴露于嗜水氣單胞菌和草魚鯉出血病毒后相對于對照魚的存活率加倍。 Cecropin已被用于斑點叉尾,,以增強對幾種致病菌的保護2-4倍。

轉基因魚之熒光斑馬魚是一項獲得專利的技術，它允許轉基因魚（老虎魚，斑馬魚）水母和海珊瑚蛋白，在紫外線下觀察時，魚呈鮮紅色，綠色或橙色熒光色。盡管這種魚最初是在新加坡國立大學創建并獲得專利用于科學研究，但德克薩斯州的一家公司獲得了將魚作為寵物進行營銷的權利。它們成為2003年推出時作為寵物公開上市的第一種轉基因動物。他們很快被禁止在加利福尼亞州出售，但他們現在再次在這個州上架。 截至2013年，熒光斑馬魚僅在美國銷售。
寵物魚的其他轉基因品系包括在其一生中保持透明的Medaka和粉紅色體色轉基因神仙魚）和表達鹿角珊瑚紅色熒光蛋白的獅頭魚。
海洋噘水III型抗凍蛋白轉基因已經成功地微注射并在金魚中表達。與對照相比，轉基因金魚表現出更高的耐寒性。
對轉基因魚進行深入研究的一個領域是通過改變生長激素（GH）的表達來增加糧食產量。物種之間的增長相對增加不同。它們的重量增加了一倍，到了相當于年齡相比，幾乎比野生型重100倍的魚。 該研究領域已經使幾種物種的生長顯著增加，包括三文魚， 鱒魚和羅非魚。其他來源表明三文魚和泥鰍的生長增加了11倍和30倍分別與野生型魚類相比。 轉基因魚類的發展已達到幾個物種準備在不同國家銷售的階段，例如古巴的轉基因羅非魚，中華人民共和國的轉基因鯉魚和美國和加拿大的轉基因三文魚。 2014年，據報道，在加拿大，中國，古巴和美國申請批準轉基因魚作為食品。
垂體腺過量生產GH會增加生長速度，主要是因為魚類的食物消耗增加，而飼料轉化效率也提高了10％至15％。
增加轉基因魚肉產量的另一種方法是“ 雙重肌肉 ”。這導致與虹鱒魚中的比利時藍牛相似的表型。它通過使用表達抑制肌肉生長抑制素的卵泡抑素的轉基因和兩個肌肉層的發育來實現。
轉基因魚之三文魚
2015年11月，美國FDA批準AquaBounty創建的轉基因三文魚用于商業生產，銷售和消費。這是第一種被批準用于人類消費的轉基因動物。這種魚本質上是一種大西洋三文魚，其中插入了一個基因復合物：一種生長激素調節來自大力士三文魚的基因，具有來自海洋噘嘴的啟動子序列。這使得轉基因三文魚能夠全年生產GH，而不是像野生型大西洋三文魚那樣暫停一年中的部分時間。 野生型三文魚需要24到30個月才能達到市場規模（4-6公斤），而轉基因三文魚的生產者聲稱轉基因魚只需要18個月才能實現這一目標。AquaBounty認為，他們的轉基因三文魚可以比目前飼養的大西洋三文魚更接近終端市場，效率更高（它們需要的飼料量減少25％才能達到市場重量）遠程沿海養魚場，從而使其更好地利用環境，回收廢物和降低運輸成本。
據稱，為了防止轉基因魚無意中與野生三文魚一起繁殖，所有的魚都是雌性和繁殖無菌的。一些轉基因三文魚的反對者將其稱為“弗蘭肯魚”。 FDA批準AquAdvantage魚被20多個反轉基因組織的財團反對。